После взрыва, который потряс Токийский саммит, на свет появился загадочный Тору Амуро. Знаменитый как "Зеро", этот опытный сотрудник Бюро безопасности национальной полиции славился своими выдающимися расследованиями и аналитическими способностями. Но его встреча с Рэем Фуруей, учеником Когоро Мори, известным детективом, перевернула его жизнь с ног на голову. Ведь Фурея тайно скрывал свою истинную личность - он был оперативником "Бурбон", членом Черного синдиката, мощной организации, занимающейся преступными делами мирового масштаба.
События привели к обвинению Когоро в ужасном взрыве на саммите, и никто, кроме юного Конана Эдогавы, не сомневался в его виновности. Но Конан был необычным парнем - на самом деле, он был Джимми Кудо, известным детективом, превращенным в ребенка после таинственного эксперимента. Уверенный в невиновности Когоро и убежденный, что истинный преступник находится среди них, Конан начал свое собственное расследование. Он знал, что разгадка этой загадки может повлиять на жизни многих невинных людей и изменить судьбу не только Когоро, но и всего мира.