В 2071 году человечество расширило своё влияние на всю Солнечную Систему, создавая колонии на разных планетах, начиная от Венеры и заканчивая Юпитером. Однако, десятилетия назад произошла техногенная катастрофа, которая уничтожила Луну. Это привело к катастрофическим последствиям: постоянные метеоритные дожди сделали жизнь на Земле невозможной, и в первые недели после катастрофы погибло 4,7 миллиарда людей. Большинство выживших переехали в колонии на других планетах, их единственное убежище.
С течением времени, преступные синдикаты стали процветать по всей Солнечной Системе, представляя серьезную угрозу. Чтобы справиться с этой проблемой, правительство восстановило древнюю практику охоты за головами. Теперь охотники за головами отправляются в путешествие по всей Солнечной Системе, чтобы найти и поймать преступников. Спайк Шпигель и Джет Блэк - два таких охотника. Судьба сводит их на космическом корабле "Bebop 268710". Вместе они нанимают Фэй Валентайн - обольстительную картежницу с огромным долгом, Радикал Эдварда - гениального компьютерного хакера, и генетически модифицированную собаку по имени Эйн. На борту "Bebop" начинаются захватывающие приключения для этой необычной команды.