Химавари Хината мечтает стать самой лучшей ниндзей в Академии Шиноби. Еще с детства, когда она была спасена загадочным незнакомцем из падающего самолета, она стремится быть такой же смелой и мощной, как он. Первый день в Академии приносит ей знакомство с новым учителем, Хаято Маденокодзи, который случайно спасает ей жизнь. Но оказывается, что Хаято - не ниндзя, а просто человек, желающий заработать деньги, чтобы расплатиться с долгами. Но Химавари замечает на его шее таинственную татуировку, такую же, как у того незнакомца, который спас ее в детстве.
Химавари заинтригована и решает разгадать тайну Хаято. Постепенно, она обнаруживает, что Хаято обладает необычными способностями, которые он скрывает от всех. Вместе они начинают тренироваться и исследовать мир ниндзя, сталкиваясь с опасностями и разгадывая загадки прошлого. Возможно, в этой загадочной татуировке кроется ключ к их судьбе и истинной силе, которая может изменить все.