После событий «Лабиринта Грисайи» главный герой Юджи Казами оказывается в очень неприятной ситуации. Его обвиняют в связях с опасной террористической группировкой, которая не только сумела проникнуть в Японию, но и обладает разрушительным оружием массового поражения. Но дело не только в этом - Михама, школа, в которой учатся Юджи и его подруги, находится на грани закрытия из-за финансовых проблем. Теперь героям остается всего месяц, чтобы решить, смириться с судьбой или сражаться за свою школу и то, что им дорого.
Смогут ли Юджи и его друзья противостоять не только стране и организации, но и своему прошлому? Смогут ли они найти доказательства своей невиновности и одержать победу над террористической группировкой? Ведь на кону не только их будущее, но и будущее Михамы. Они готовы рискнуть всем, чтобы спасти свою школу и проложить себе дорогу к светлому завтрашнему дню. Уже сейчас начинается смертельно опасная игра, и на кону больше, чем просто жизни героев. Вопрос только в том - кто останется на плаву, а кто погрузится во тьму.